在台灣，陸委會副主委邱垂正表示，密切關注包括台灣保護傘餐廳發起人黃國桐在內11名港人，被香港警方以涉嫌協助12港人偷渡台灣為由拘捕的事件，呼籲港府以包容態度面對人民訴求。台灣銅鑼灣書店店長林榮基認為，港人已經沒有人身安全保障，呼籲儘快離開，他相信第三波大抓捕即將來臨，並猜測可能針對網媒和網路言論進行肅清，確保沒有人能夠再批評港府。
陸委會副主委邱垂正回應香港警方的拘捕行動表示，香港今天又發生黃國桐律師等多人被抓捕事件，國際社會跟台灣，都會密切關注事件的發展。
2021年1月14日，陸委會副主委邱垂正：不要再變本加厲打壓異議人士，才是維繫香港繁榮穩定的根本之道。
邱垂正說：中共既然宣稱在港實施一國兩制港人治港、高度自治，就應該貫徹承諾，保障並尊重港人擁有自由、民主、人權、法治的相關權利。然而，港版國安法實施以來，國際社會對相關方面傷害人權的作為屢有質疑，予以批評。
邱垂正指出，近期香港民調也顯示，有高達百分之七十二的港人，對於過去一年香港的發展感到不滿，也有百分之六十的民眾認為，過去一年生活不快樂。
邱垂正說：我們要再次呼籲、相關方面要以包容、理性的態度，面對人民的訴求，不要再變本加厲政治打壓異議人士，這台是維繫香港繁榮穩定的根本之道。
台灣銅鑼灣書店店長林榮基接受本台訪問時表示，港府進行第一次大抓捕時，就預期會有第二次，但沒想到那麼快就發生。他認為港人處境目前相當危險，自身安全沒有保障，呼籲能夠離開的儘快離港。
林榮基說：現在香港好像史太林一樣，沒有辦法，香港人真是不走不成。而且我擔心，現在是第二波大抓捕，相信第三波陸續有來。很明顯港府以藉口先沒收反抗者的護照，不讓他們離開香港，這是不是變相限制了香港人的人身自由？我們現在不清楚他們是不是，有參與所謂12個香港人離開香港那件事。雖然港警是這樣說，但是不是往後第三波又用這樣的藉口一路放大呢？這樣真是會人人自危的。
林榮基呼籲台灣當局，在港人面對迫害的時刻，放寬並加快速度收容以政治因素申請來台港人。
林榮基說：我希望 中華民國政府，在處理一些想過來的抗爭者的程序，審批加快一點。據我所知有些人是想離開，因為這邊（台灣）的程序不夠快，結果來不了台灣後來更被檢控，我聽到的情況就是這樣。
林榮基認為，港府近期連續兩輪大抓捕，是看準美國政權交替的時刻，沒有時間對香港議題作出反應。他預估，第三波大抓捕即將來臨，而是好有可能是針對網路言論進行肅清。
林榮基說：你看到國安法的內容很模糊包山包海，這樣下一波是不是那些網台和寫評論的人？會不會抓捕的範圍再放大呢？大家都看到，香港還有很多人在網路上發表政見，對香港政府批評，下一波會不會是這些人？甚至現在看到一些網媒被搜查，他們的記者會不會有事？我擔心他們會一路牽連出去。港府要的是香港人閉嘴，就是不要有任何抗爭的行為。
至於黃國桐在台北市台灣大學對面成立的保護傘餐廳，今天照常營業，店內工作人員不願就事件回應。在餐廳用餐的台大學生表示，看到新聞知道創辦人被捕，特地前來用餐表達對港人支持。
