圖為1月29日，中共上海市委副書記、市長組長應勇在上海市公共衛生臨床中心傳染病診治網絡指揮中心「指導工作」。（圖：上海市公共衛生臨床中心網站）
1月12日，上海專家團隊發佈全球第一個新型冠狀病毒（COVID-19）基因組序列的第二天，其P3實驗室突遭當局關閉。此前一周，該團隊已向中共國家衛健委提交該序列，同時向國際期刊提交研究報告，指新冠病毒與中共軍方的2個病毒樣本最相似，當局此舉被疑是「學術消聲」。
被關閉的P3級別實驗室位於上海（復旦大學附屬）公共衛生臨床中心，又名復旦大學附屬中山醫院南院。領銜研究的張永振教授是該中心「華東病原體發現與研究中心」主任，兼任復旦大學公共衛生學院教授，中國疾控中心研究院院士。
研究團隊於1月11日在國際病毒學論壇virological.org網站率先發佈了新冠病毒全基因序列；次日，該序列在美國國立衛生研究院（NIH）的基因銀行發表（註：14、17日兩次更新），而中共當局在1月12日當天以「整改」為由關閉了該實驗室。
顯微鏡下的新型冠狀病毒（COVID-19）。（圖：公有領域）
綜合大陸財新網和《南早》2月28日報導，早在官方宣佈發現武漢肺炎2天前的1月5日，張永振團隊已完成全基因測序。上海公衛中心當日立即向上海市衛健委和國家衛健委等主管部門報告，提醒他們新病毒與SARS相似，建議採取適當措施防止疫情擴散，因為樣本採集來源的病人，病徵都非常嚴重。
1月6日，中國疾控中心內部啟動二級應急響應。但等到1月11日，團隊仍未見當局回應，才決定公開序列。那個時候，中國民眾還被告知，武漢從1月3日起已無新確診病例、沒有明顯人傳人跡象。
消息人士透露，「上海公共衛生臨床中心臨時關閉，但沒有解釋原因，我們曾經四次申報要求重開，但一直都沒有得到回覆。」關閉實驗室對科學家和的研究有很大影響，「因為他們正在與時間競賽，希望儘快找到控制冠狀病毒的辦法」。
報導也指，公衛中心這間生物安全3級實驗室剛在1月5日通過國家年檢，1月24日獲得了研究冠狀病毒的遲到的批文。下令關閉實驗室的是上海市健委。
1月4日（中共）「國家認可委」在上海市公共衛生臨床中心舉辦「年度監督評審會議」。（圖：上海公衛中心網站）
另據陸媒報導，在張永振團隊發表全球首個病毒基因序列的第二天，由國家衛健委領導的小組還在全球共享流感病毒數據庫中發佈另外五個病毒基因組序列；隨後國家衛健委改變原計劃，棄用張永振的序列，改用官方指定的中國科學院武漢病毒研究所的病毒基因組序列向WHO匯報。
張永振團隊率先發現新冠病毒基因異樣
1月3-5日（中共）「國家認可委」在上海市公共衛生臨床中心舉辦「年度監督評審會議」。前排右三為該中心「華東病原體發現與研究中心」主任張永振。（圖：視頻截圖）
外界也質疑，復旦大學實驗室被關閉另有內情，考慮到張永振團隊是率先提出武漢病毒最像中共軍方病毒的中國科研團隊，此「整改」恐非未經批准「擅自」公開基因組序列那樣簡單。
1月7日，張永振團隊根據基因測序，向《自然》（nature）雜誌提交一篇論文（2月3日發表 ），明確提出新冠病毒與舟山蝙蝠病毒的2種樣本（編號CoVZC45和CoVZXC21）親緣關係最密切。其中，新冠病毒與CoVZC45的核苷酸序列同一性為89.1%，nsp7和包膜蛋白（E蛋白）的氨基酸相似性達100%。據基因銀行公開資料，這2個樣本由中共軍方於2018年上傳。
這一結論與希臘研究團隊和郭媒體顧問專家團隊的結論相一致，兩個團隊均作出推論，武漢病毒並非靠自然演變而來。微生物學博士、曾任美國Walter Reed陸軍研究所病毒系實驗室主任肖恩‧林（Sean Lin）近日也告訴大紀元，E蛋白在整個宿主都變換掉的情況下保持完全相似，基本不可能自然發生。
在張永振論文發表同日，武漢病毒所石正麗團隊的論文也在《自然》雜誌發表，稱新冠病毒與該所2013年發現的雲南蝙蝠病毒RaTG13相似性超高。海外專家指出該病毒並非新冠病毒的直系病毒等多個漏洞，批其造假過於明顯。
張永振團隊的研究發表後，評論也指其「打臉」石正麗。該團隊向國家衛健委提交基因序列同時，是否匯報了有關親緣關係的發現不得而知，但中共急整改實驗室，無疑是「學術消聲」之舉。
