公元8世紀，阿拉伯半島的伊斯蘭教興起，阿拉伯人（中國稱「大食」）進入並控制吐火羅。因為中亞一系列小國歸屬問題，公元751年，阿拉伯帝國與唐帝國爆發了怛羅斯之戰，唐軍戰敗，自此，蔥嶺以西之西域諸國盡皆歸於阿拉伯人，中亞地區逐漸開始伊斯蘭化。
公元821年，阿拉伯帝國阿拔斯王朝（中國稱「黑衣大食」）的霍拉桑總督塔希爾，在名義上承認巴格達的哈里發主權的基礎上，在阿富汗區域建立起塔希爾王朝。
到了867年，阿拉伯帝國錫斯坦省的軍隊統帥亞庫布（綽號「薩法爾」）建立薩法爾王朝，並在7年後攻滅塔希爾王朝；不久，河中地區又興起波斯將軍建立的薩曼王朝，公元900年，滅薩法爾王朝，阿富汗區域再度易主。
962年，霍拉桑突厥族總督阿爾普特勤據加茲尼城獨立，建立加茲尼王朝，稱雄一方，並在隨後不久征服今日阿富汗全境。
加茲尼王朝在阿富汗的統治，一直持續到12世紀初期。此後，赫拉特與加茲尼之間的古爾山區興起了古爾王朝，攻滅了加茲尼王朝，佔領了阿富汗全境。
1215年前後，古爾王朝又被興起於河中的花剌子糢王朝所滅；1220年前後，花剌子糢王朝又被蒙古人攻滅，阿富汗人再換主人——此後，隨着蒙古諸汗國的互相攻殺，阿富汗相繼被伊爾汗國（蒙古人佔領波斯之後的政權）和察合台汗國所統治。
1370年，西察合台汗國的蒙古貴族帖木兒，先後奪取了波斯和阿富汗區域，而帖木兒更是遷都至赫拉特（今阿富汗赫拉特），以此為中心，建立起中亞規糢最大的帝國，此後阿富汗一直處於帖木兒及其後裔的統治之下。
帖木爾死後，阿富汗成為帖木爾後裔與波斯建立的黑羊王朝、白羊王朝（均為土庫曼人建立）爭奪的戰場，幾易其手，而帖木兒的五世孫巴布爾，以今喀布爾為根據地，力圖復辟帖木兒帝國，但最終敗於白羊王朝，失敗後進入印度，於1526年在印度北部建立莫臥兒帝國。
此後不久，阿富汗的普什圖族人舍爾-沙，利用莫臥兒帝國皇帝征戰古吉拉特的間隙，趁機在印度北部自立為王，並在1540年佔領德里，建立起蘇爾王朝，統治了西起阿富汗喀布爾，東到今日孟加拉國的大片領土，並發行貨幣，實施各種現代改革——他劃分省份，修築幹道，設立驛館和郵傳，鼓勵商業貿易，改革田賦制度，廢除苛捐雜稅，只徵收海關稅和市場稅，同時廢除舊幣，重新鑄造金、銀、銅幣。
蘇爾帝國所鑄造的銀幣叫做「盧比亞（Rupya）」，這正是後來的印度貨幣「盧比（Rupee）」的最初名稱，名稱源於烏爾都語，意思是「有形狀的」、「蓋戳的」、「硬幣」等意思。
因為舍爾沙的開明統治，普什圖人在阿富汗區域的地位迅速抬升。
可惜，舍爾沙在戰場上陣亡之後，蘇爾王朝迅速陷入崩潰，其所佔領的印度領土也很快又被莫臥兒王朝復辟——但舍爾-沙所創立的一套財政、貨幣和賦稅體系，卻被莫臥兒王朝完整地保留了下來（含盧比銀幣），成為莫臥兒王朝統治的法寶。
至於阿富汗這塊區域，則再度被波斯的薩菲帝國征服。此後100多年間，阿富汗一直隸屬於波斯薩菲帝國的一部分。
1747年，波斯皇帝納迪爾遇刺，但其衛隊隊長、阿富汗普什圖族人艾哈邁德-沙阿-杜蘭尼卻趁亂掌握了其衛隊和皇帝的寶庫——隨着波斯帝國之後陷入內亂，在一堆阿富汗部落長老們的擁戴之下，杜蘭尼逐漸統一了阿富汗各部落，從而建立起杜蘭尼王朝。
「阿富汗」這個詞的普什圖語意思，就是「普什圖族人的地方」。
不過，杜蘭尼並沒有實施普什圖人的專制統治，反而成立了9人制的顧問團，用開明的方式治理這片土地。在其統治之下，今日阿富汗境內的各個部族，如普什圖人，哈扎拉人，烏茲別克人都和諧相處。
不僅如此，杜蘭尼還積極向舍爾沙「學習」，在對外擴張方面，一路向東奔襲，達到了印度的德里，直接把莫臥兒帝國的皇帝給廢了，扶持起一個印度傀儡皇帝——與此形成對比，英國剛剛開始殖民印度，在加爾各答這個地方被土著們折騰得雞飛狗跳，不得不廢掉印度總督……
當時的杜蘭尼王朝，變成了伊斯蘭世界中僅次於奧斯曼帝國的大帝國，而這一區域的人民，第一次形成民族意識，這一區域從此被稱為「阿富汗」，艾哈邁德-沙阿-杜蘭尼，由此被稱為阿富汗的「國父」。
可惜的是，1772年杜蘭尼死後，其不肖子孫開始為爭奪王位大打出手，國家自此陷入分裂和內鬥，不僅退出印度，且一度分裂成五個邦國，直到1826年，普什圖人多斯特-穆罕默德奪取皇帝位，阿富汗政局才再度穩定下來，由此建立起阿富汗的巴拉克宰王朝。
多斯特掌權之後，立即面臨北邊的沙俄和東邊英國（東印度公司）的擠壓。
因為多斯特選擇與沙俄合作，英國東印度公司便扶持了杜蘭尼的一個孫子舒賈沙。1838年，靠着東印度公司的精良武裝，舒賈沙把多斯特給趕下台。
1841年，在與中國的鴉片戰爭中順利取勝、佔盡便宜的英國人，接下來，準備拷貝與中國的糢式，與阿富汗政權好好談談利益的問題。卻不想，談判中，兩邊的部隊忽然間起了衝突，派駐阿富汗的總督，居然在衝突中被阿富汗人砍了頭，懸掛在旗杆上。
英國人大怒，命令舒賈沙出兵鎮壓，沒想到舒賈沙順勢舉起抗英大旗。再加上「阿富汗之星」阿克巴爾領導喀布爾起義，來到阿富汗的英國人，頓時陷入「人民戰爭的汪洋大海」。此後兩年，包括軍隊、家眷和僕役在內的1.65萬英國人，幾乎盡數遭到屠殺，僅有幾個人僥倖活下來逃回印度。
要知道，這可是大英帝國最強盛的時代，居然這樣被屠殺！英國震怒了，派遣兩位將軍，帶着當時最精良的武器裝備，一舉攻陷喀布爾，放火燒城……此時舒賈沙已死，英國人想想，還是多斯特比較靠譜，於是又把多斯特給扶上了王位之後，才退出阿富汗。
然而，這一次的放火焚城，卻讓阿富汗人對西方人的痛恨，埋下了禍根。一直到今天，整個阿富汗的保守力量，都會動不動拿這場大火做例子，來說明西方人對阿富汗的「禍心」。
1878年，因為沙俄派人勸說阿富汗國王希爾-阿里汗（多斯特的兒子）與俄國結盟，英國人第二次侵略阿富汗，最終簽訂條約，主權獨立，外交歸英國人。
為了對抗英國，1885年沙俄強佔阿富汗領地「彭迪」綠洲，英俄就這麼着在阿富汗槓上了。
直到1893-1894年，阿富汗、英國、俄國相繼簽署條約，英俄明確了自己的勢力範圍，英國還劃了一條「杜蘭德線」作為了阿富汗和英屬印度的分界線。另外，把瓦罕走廊（今天阿富汗凸出來和中國接壤的那塊地兒）劃給阿富汗作為俄英之間的緩衝區。在此之前，這裏是屬於清王朝的附屬地，英俄兩大流氓拿着大清的領土當緩衝區，大清卻毫無辦法。
這個杜蘭德線也值得一說。因為把普什圖人的土地給分成了兩塊兒，線東邊的普什圖人，原來一直認為自己是阿富汗人，後來變成了印度人；二戰之後印巴分治，又變成了巴基斯坦人。可在普什圖族的民族主義者看來，凡是普什圖族人居住的地方，都應該歸屬阿富汗呢！
攘外必先安內。1880年繼位的阿不杜勒-拉赫曼，開始加強阿富汗中央集權。對於不服從的部落，如哈扎拉人，國王出動大軍進剿，甚至採取變賣為奴、強制遷徙等手段迫使其歸順；在全國設立行政區劃，有意識地把同一部落劃分到不同省份；依靠着從平民中提拔的人才，建立起中央政府的各行政部門，改僱傭兵為徵兵制，優待軍人，形成強大的中央軍……
雖然拉赫曼的強力集權之路褒貶不一，但拉赫曼確實塑造了一個統一的阿富汗。
1901年，哈比布拉汗（多斯特後裔）登基。他雖說是個紈絝子弟，但對於很多現代化的新奇事物十分感興趣，將西方的數學、外語、繪畫以及科學等引入喀布爾，同時修建了水電站，還買了幾台汽車，引進電話；與此同時，他還引進西方的學者、專家，又在王宮周圍修了幾條現代化的馬路……
