據時事通信社報導，日本中央政府已選定沖繩縣西南先島群島上的五個市町村建立緊急避難所，在外國軍隊襲擊時，當地居民可在這些避難所停留兩周左右。東京周五公佈的避難所建設基本方針中明確規定了這五個市町村。考慮到台灣可能出現的緊急情況，政府將加快與這五個市町村的相關協調工作。
石垣市和宮古島市、竹富町和與那國町以及多良間村這五個地區之所以被選中，是因為它們符合兩個條件：位於偏遠的島嶼上，疏散困難；它們已經制定並公佈了所有居民的疏散計劃，並與中央政府和都道府縣政府一起進行了民防演習。
日本中央政府還制定了技術指南，規定了避難所的規格。指導方針規定，假設發生彈道導彈和空襲等四種武裝襲擊，避難所的牆壁和地板原則上至少應厚30厘米。指導方針還要求儲備食品和飲料，建立重要的基礎設施，並確保每人約2平方米的空間。
岸田政府於2022年底修訂的《國家安全保障戰略》要求努力確保各類疏散設施的安全，以便居民能夠在武裝襲擊發生之前提前疏散。據悉，截至2023年4月1日，日本全國共指定了約5.6萬個緊急臨時疏散設施，包括混凝土建築和地鐵站。
