2024年11月24日上午，中華民國民眾黨主席兼總統參選人柯文哲（前右）與副手搭檔吳欣盈（前左）前往中選會登記。（中央社）
中國國民黨與民眾黨的「藍白合」破局後，民眾黨內掀起一波退黨潮，包括前基隆市議員候選人徐佑昇、彰化縣議員陳重嘉、陳銌銌宣佈退出民眾黨。民眾黨彰化縣議會黨團更因2名議員退黨面臨解散。
前基隆市議員候選人徐佑昇於「藍白合」破局當天，24日在臉書發文以「再會了，我曾經深愛的民眾黨，我曾經以為的新政治」為題宣佈退黨，並提出爭議問題批評民眾黨，包括國民黨基隆市議員呂美玲加入民眾黨風波、前台北市副市長暨民眾黨總統參選人柯文哲競選總幹事黃珊珊「球員兼裁判」，以及柯文哲選新光集團吳家第三代大公主吳欣盈任副手，讓他決心退出民眾黨。
台灣陸軍第六軍團基隆彈藥分庫祥豐營區7月24日發生爆炸，造成2重傷、7輕傷。前國民黨基隆市議員呂美玲主張讓彈藥庫搬遷的議題重啟。面對基隆認為彈藥庫是保護台灣不受中共入侵、不能搬遷，呂美玲竟嗆他「中共不想打你，那是你討打」，引發台灣各界反彈。
台灣民眾黨彰化縣議員陳重嘉24日宣佈退黨，陳重嘉拒絕說明退黨原因。彰化縣民眾黨籍縣議員陳銌銌28日也發佈退黨聲明表示，隨着柯主席及侯市長陸續完成登記，似乎初衷已不復存，她正式退黨。
民眾黨在彰化縣議會原有張雪如、陳重嘉及陳銌銌三名議員，民眾黨10月26日宣佈彰化縣議會民眾黨團成立，民眾黨主席柯文哲到場見證，他致詞時強調，這是民眾黨跨出台北市的一大步。彰化縣議會目前民眾黨議員只剩一人，民眾黨黨團在成立未滿1個月即面臨解散。
柯文哲28日回應陳重嘉、陳銌銌相繼退黨，是否與「藍白合」破局有關，以及是否衝擊民眾黨中部選情。柯文哲說，「（藍白合破局）應該是原因之一吧」。他認為，這只是震盪期，雖有可能影響選情，但是他對這場選舉還是很有信心，預料震盪期約兩周時間，過程難免紛擾，待大家沉澱完，就會重新整隊出發。
此外，台東立委選舉，今年初重返國民黨，爭取提名或徵召參選立委，但未獲國民黨提名的前台東縣政府建設處長許瑞貴，以及宣佈退出國民黨的高美珠，2人分別以無黨籍登記參選台東區域及平地原住民立委；國民黨台東縣黨部表示，將依黨紀規範處理。
另外，現任立委劉櫂豪退出民進黨，22日前往台東縣政府大禮堂登記參選立委。民進黨中央黨部說，即使申請退黨而逕行參選，視同違紀參選，處除名處分，中央黨部將移請中評會認定退黨參選事實，並依規處理。
