中國民主運動活動家魏京生在新唐人《菁英論壇》節目表示，秦剛的問題肯定不是因為生病，如果真的得了絕症，好不了了，你公佈出來就行了，而且也不用保留什麼國務委員的頭銜了，所以這跟生病沒關係，應該還是內鬥的問題，秦剛有幾個特點可能在外交系統內部遭到極大的排斥。
魏京生說，外交系統也分很多派系，秦剛出身的這個國際關係學院是一個比較小的、倒數第二的一個小派系，這是個特務派系。
以前一個老的外交部的副部長在我家吃飯的時候跟我們聊過，他們外交系統都特別討厭安全部特務系統的人，因為這些人在大使館裏好像是他們的太上皇一樣，不幹事兒，經常找茬，而且還經常通過中調部（中共中央調查部，是中共國安部的前身）往上邊匯報什麼東西，可能會影響你的身家性命，所以大家又怕他們，又討厭他們。那個時候外交部的大使回國以後，第一個述職的匯報是到中調部去匯報，不是到外交部匯報，所以大家都特別討厭這些中調部現在是安全部派出來的這些特務。而秦剛恰恰就是這麼一個角色出身的，雖然他一直在外交系統，但是他一直是安全部的人，他的身份在外交部比較尷尬。
