10月11日，兩架東航飛機險些在上海虹橋機場的跑道發生碰撞，好在正在加速起飛的機長果斷起飛，避免兩機相撞的慘劇。與死神擦身而過的一名乘客接受採訪時告訴新聞117記者，當時的險情除了引起一點震動外，他們在客艙內渾然不知，直到下了飛機看了新聞，才知道撿了一條命。
事故原因指向塔台管制員指揮失誤
「@東方航空」微博發佈消息稱：2016年10月11日下午12點03分，在虹橋機場運行過程中，機組按空管指令飛行，發現飛行衝突，及時機動處置，此情況已報民航有關部門調查。
新聞117記者調查發現，東航A320/B-2337號機執行MU5643（上海虹橋-天津）航班，飛機於11：54（北京時間）滑出，12：03（北京時間）塔台指揮飛機進跑道36L，機組在執行完起飛前檢查單之後進跑道，12：04（北京時間）塔台指揮：跑道36L，可以起飛。機組在確認跑道無障礙的情況下，執行起飛動作，在速度110節左右，機長發現一架A330（經調查，該飛機是東航MU5106航班）準備橫穿36L跑道，立即讓中間座詢問塔台，此時機長觀察並確認該A330在穿越跑道，此時飛機速度130節，機長短暫判斷後決定起飛，於是TOGA（最大起飛復飛推力），帶杆起飛，飛機從A330上空飛越，監控飛機狀態正常，並將情況匯報塔台，後續飛行正常。飛機CVR和FDR（即飛機的兩個黑匣子）已經拆下進行譯碼。
示意圖：紅色箭頭和粉色箭頭分別代表MU5643和MU5106的軌跡
12日下午，中國民航局官網發佈《關於10月11日虹橋機場發生飛機衝突事件的通報》稱：民航局調查組連夜對10月11日發生在上海虹橋機場的兩架飛機衝突事件進行了調查，初步判斷，該事件是一起因塔台管制員指揮失誤造成跑道侵入的不安全事件。事發後，民航局領導高度重視，成立了由民航局、民航華東地區管理局共同組成的調查組，分別對事發相關人員進行了調查問詢，調取通話錄音、雷達錄像，並對兩架涉事飛機的飛行數據記錄器、駕駛艙語音記錄器進行了譯碼。目前，調查工作還在進行中。
涉險乘客：平穩滑行時突感晃動，看新聞才知道撿條命
幾經周折，新聞117記者找到一名搭乘東航MU5106航班的乘客，他是下了飛機回到酒店看新聞時候才知道這件事，發現新聞報道中的航班竟是自己乘坐的。這位乘客回憶說，因為工作出差他經常乘坐這個航班，感覺之前飛機下降時，盤旋的時間比平時略長，下降後，他習慣性地解開安全帶，坐在位置上等候飛機滑入指定區域，本來飛機已經平穩滑行，他突然感覺到顛簸和震動，當時根本沒在意這些細節。「想想真是後怕，另外一架飛機和我們擦身而過，真是撿了一條命。」
