中共政府稱孔子學院只是提供中文和文化教學,但是與德國的歌德學院、英國大使館文化教育處和法國文化教育處不同,中國的孔子學院通常把實體機構設立在校園內,並為高校開設課程,同時也扮演了在大學校園內推行中共當局政策的角色。加拿大教師協會不是高校系統唯一對孔子學院表示擔心的。加拿大西部的曼尼托巴大學由於擔心中國方面的政治審查,例如不能談西藏和台灣問題等,拒絕接納孔子學院;另外,麥克馬斯特大學去年2月份終止了與孔子學院的合作。