這個協議的終結將意味着兩岸最大的交易完結，斬斷兩岸政治關係中僅存的少數聯繫之一。中華民國政府官員表示，兩岸經濟合作框架協議的終結將只損害台灣與中國貿易的不到5%。分析人士表示，中共希望讓台灣經濟上更難過，但台灣已經準備好一旦中共取消協議。蔡英文總統在努力通過「新南向政策」擴大與19個南亞和東南亞其他國家的貿易關係。
