深圳賽格廣場大廈晃動原因至今仍未查明。從6月1日起，有關部門在賽格廣場大廈開展激振試驗等測試工作。
5月31日深圳官方通報稱，為儘快查明原因，從6月1日起，賽格廣場大廈將開展激振試驗等一系列試驗、測試工作。該類試驗從原理上可能會引發大廈主體振動，但不會影響主體結構安全。
一名從事土建工程的人士對財新網表示，激振試驗即利用設備對大廈施加振動，以測試大廈的反應特性，為後續建模計算核對參數，「也就是通過模擬振動的方式倒回分析」。他預計，後續可能還需要對大廈周邊的振源展開排查，如大廈周邊建築環境、風場等。
5月18日晚間，廣東省應急管理廳曾發佈內部報告，對異常振動的原因作出初步調查結論。報告認為，大廈振動系上下震顫，而非左右晃動。
報導引述多名建築領域專家的話表示，常規來說，風對高層建築物的影響大多是左右晃動，非地震影響情況下，建築物上下顫動的可能性較低。
之後連續多日晃動。5月21日，深圳賽格集團發佈通知稱，自21日零時起，暫停所有業主、商戶、租戶進出賽格大廈寫字樓和電子市場，待相關檢測工作完成後再有序開放。
「5月18日下午晃動的那一次最明顯，跑下來後覺得頭暈想吐，有點像暈船的感覺。」一位當時在賽格大廈電子企業工作的「親歷者」告訴《中國經濟周刊》，「開始還以為是地震，準備鑽到角落避難，後來聽到有人在樓梯間大喊『快跑呀』，才跟着大家一口氣跑到一樓廣場，回頭一望發現只是大廈樓體在顫動。」
一位在賽格通信市場內開店的店家表示，華強北的樓宇密集，人流量較大，賽格大廈不僅樓層高而且就在通信市場隔壁，徒步距離不到10米，很多人都擔心賽格大廈的情況會影響到周圍，所以比較關心其後續調查結果。
根據官方監測數據稱，自5月18日晚21時至31日中午，賽格廣場大廈的振動、傾斜、沉降情況均未超出標準要求。此外，鑑於該大廈未安裝阻尼器，專家建議，下一步可以考慮安裝阻尼器以提高防風防震能力和舒適度。
一篇20年前的碩士論文《深圳賽格廣場建設項目評析》曾指，當年作為深圳地標建築的賽格大廈，建設中存在部分問題。諸如，存在邊施工邊修改設計，先施工後設計，設計圖沒做完就開始施工等。
