同姐姐黎紹芬一樣,黎紹基也沒能在文革中逃過迫害。他的家被抄,銀行存款和海外子女的匯款都被凍結,每月的生活費用十分微薄,不得已他前往天津的弟弟黎紹業家中避難。不僅僅是黎元洪的子女遭到了中共的迫害,黎元洪死後也不得安生,其墳墓被紅衛兵用炸藥炸開並挖掘,部分隨葬品被省博收藏。