釣魚島撞船事件發生後，中國派駐到釣魚島附近海域進行護漁巡邏的兩艘漁政船，周三沒有再露面。中國民間保釣人士對中共政府在事件上採取軟弱態度表示失望。另外，美國與日本將在12月採取聯合軍演，期間不排除會在釣魚島附近海域進行演習。（畢子默/維靈報道）
日本傳媒引述日本海上保安廳透露，最近一直在釣魚島附近海業巡航的兩艘中國漁政船從周三凌晨起沒有再出現。日本內閣官房長官表示，不清楚中國漁政船撤出該海域是否與中日兩國首腦周一在亞歐峰會期間進行交談有關。
對於中國周三從釣魚島海域撤出兩艘漁政船一舉，中國民間保釣聯合會發言人李楠在接受本台記者採訪時對事件表示失望，認為中共當局在這次釣魚島紛爭上態度不夠強硬。李楠透露，事發至今大陸保釣人士一直沒有放棄出海前往釣魚島的努力，但至今兩、三次行動均被中國有關當局攔下。
中日發生撞船事件後，中國隨即派出兩艘漁政船前往釣魚島海域執行護漁任務。外交部發言人姜瑜上月底在新聞發佈會上明確指出，釣魚島附近海域是中國漁民傳統的作業漁場，中方派遣漁政執法船是依據中方相關法律法規開展的漁業管理活動，目的是維護漁業生產秩序。
另一方面，日本外相前原誠司周二晚接受外媒詢問時強調，這次中國漁船撞擊日本保安廳巡邏艦事件與過去多起釣魚島海域內中國及台灣等漁船進入或碰撞事件不同，經調查，保安廳認為這次中國漁船是有意撞擊巡邏艦，因此，若相同情況再度發生，日本仍將以基於國內法律進行處理。但前原亦強調，中日雙方應坐下好好談話，以雙方智慧防止類似事件再度發生。前原指，日方的對話大門隨時敞開。
而就記者提問美日是否有計劃在釣魚島海域附近舉行聯合軍演，前原的回答就暗示，不排除這種可能性。
日本共同社報道引述日美消息人士消息透露，日本與美國正在就日本自衛隊和美軍計劃12月舉行的聯合軍演進行調整，美國將會派出航母參加是次聯合軍演。美國國防部發言人莫雷爾表示，美日兩國政府是次聯合防衛演習是一早計劃好，與中日撞船事件無任何關係。而日本首相菅直人周三在眾議院會議上就表示，是次聯合軍演「沒有假象釣魚島事件實施演習的計劃」。
目前，日本國內的反華情緒仍然高漲，共同社公佈在周二及周三針對全國的電話輿論調查，結果顯示有逾72%受訪者認為日本釋放中國船長的決定不妥當。而日本《讀賣新聞》周一發表的民調更顯示，日本認為中國不可信賴的民意創下該報民調最高紀錄，數字達到84%。